Les deux petites tours blanches qui ferment la darse semblent aussi anciennes que la basilique, et beaucoup les prennent pour des œuvres palladiennes. En réalité elles racontent la période la plus basse de l’histoire de l’île, celle qui a suivi la chute de la République. En 1806 Napoléon a supprimé le monastère et les moines ont été regroupés à Santa Giustina de Padoue ; un seul religieux, Placido Ragazzi, n’a pas voulu abandonner l’île.