El Ponte San Tomà cruza el rio homónimo (un pequeño canal veneciano) en el sestiere de San Polo (el distrito), entre la Fondamenta San Tomà y la Calle dei Nomboli: un puente de piedra con estructura de ladrillos y bandas de hierro en arcos góticos. El rio baja del Gran Canal, entre el Palazzo Marcello dei Leoni y el Palazzo Giustinian Persico, y a lo largo de la fondamenta y el campiello se llega al traghetto.