Der Ponte San Tomà überspannt den gleichnamigen rio (venezianischen Kanal) im sestiere (Stadtteil) San Polo, zwischen der Fondamenta San Tomà und der Calle dei Nomboli. Die steinerne Brücke hat ein Ziegelgewölbe und schmiedeeiserne Geländer mit gotischen Bögen. Der rio fließt vom Canal Grande zwischen Palazzo Marcello dei Leoni und Palazzo Giustinian Persico hindurch.