Le Ponte San Tomà enjambe le rio homonyme dans le sestiere de San Polo, entre la Fondamenta San Tomà et la Calle dei Nomboli : un pont de pierre à structure de briques et bandes de fer à arcs gothiques. Le rio descend du Grand Canal, entre le Palazzo Marcello dei Leoni et le Palazzo Giustinian Persico, et le long de la fondamenta (le quai) et du campiello on arrive au traghetto.