L’unica chiesa confraternale di Venezia pensata come sacrario del proprio santo: una prima chiesa a San Rocco era sorta in questo sito già nel 1478, poi abbattuta: quando nel 1489 la Scuola Grande ottenne dal Consiglio dei Dieci il permesso di tornare qui accanto ai Frari Minori, la ricostruì e la volle come sacrario del santo pellegrino protettore della peste, arrivato a Venezia nel 1485 e traslato qui nel marzo del 1490.