La seule église confraternelle de Venise pensée comme le sanctuaire de son propre saint : une première église de San Rocco s’était levée sur ce site dès 1478, puis a été abattue ; quand en 1489 la Scuola Grande a obtenu du Conseil des Dix la permission de revenir ici à côté des Frari Minori, elle l’a reconstruite et l’a voulue comme sanctuaire du saint pèlerin protecteur contre la peste, arrivé à Venise en 1485 et transféré ici en mars 1490.